Ցողունային բջիջների կիրառմամբ իրականացվում է մոտավորապես 70 հիվանդությունների բուժում` 80-90%-ով: Ցողունային բջիջների կիրառումը լայն տարածում ունի տրանսպլանտացիոն բուժման մեջ: Ցողունային բջիջները կիրառվում են արյան, նյարդաբանական, սրտաբանական հիվանդությունների բուժման գործընթացում:
Օրինակ` սրտամկանի իշեմիկ հիվանդության դեպքում ստենտավորման ընթացքում ներարկվում են ցողունային բջիջիներ, որոնք վերածվելով սրտամկանի բջիջների, հետագայում ապահովում են սրտի անխափան աշխատանքը: Ցողունային բջիջները կիրառվում են նաև վնասվածքաբանության և օրթոպեդիայի բնագավառում: